Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB4A4D0S4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB4A4D0S4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMB4A4D0S4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms