Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GTW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms