Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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TRBV2A0A0J9YWF9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRBV2A0A0J9YWF9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRBV2A0A0J9YWF9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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