Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JMD5

PRAMEF33, PRAME family member 33, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms