Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRG3Q9Y2Y8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms