Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms