Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms