Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms