Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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