Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TMEM30AQ9NV96 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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