Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms