Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SP110Q9HB58 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SP110Q9HB58 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP110Q9HB58 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SP110Q9HB58 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SP110Q9HB58 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SP110Q9HB58 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SP110Q9HB58 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SP110Q9HB58 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP110Q9HB58 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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