Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms