Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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