Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGBD4Q96DM1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGBD4Q96DM1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGBD4Q96DM1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PGBD4Q96DM1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms