Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF183Q96D59 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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RNF183Q96D59 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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RNF183Q96D59 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RNF183Q96D59 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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RNF183Q96D59 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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RNF183Q96D59 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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RNF183Q96D59 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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RNF183Q96D59 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF183Q96D59 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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