Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms