Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKD2Q969F2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms