Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms