Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms