Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms