Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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