Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms