Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CATSPER4Q7RTX7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms