Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms