Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms