Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms