Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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