Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTC1Q2NKJ3 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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