Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC27Q2M243 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms