Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRC36Q1X8D7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms