Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC142Q17RM4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC142Q17RM4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CCDC142Q17RM4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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