Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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