Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms