Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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VPS72Q15906 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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