Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms