Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CUL4AQ13619 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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