Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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