Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PPP1R1AQ13522 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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