Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TCIRG1Q13488 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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