Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms