Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR5A1Q13285 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR5A1Q13285 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms