Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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