Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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FOXI1Q12951 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
FOXI1Q12951 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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