Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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