Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DDR1Q08345 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms