Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms