Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms