Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJC1P36383 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms