Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms